En una nueva charla del ciclo de conversaciones científicas de Data Observatory, el doctor Juan Ugalde, biotecnólogo especialista en genómica y líder del equipo Microbial Data Science de la Universidad Andrés Bello (UNAB), analizó la oportunidades que ofrece la ciencia de datos para comprender el universo microbiano. El investigador forma parte del Centro de Bioinformática y Biología Integrativa (CBIB/UNAB), y habló de la necesidad de crear un “repositorio nacional sobre datos de genómica microbiana ”.

En una interesante conversación, el académico explicó la relevancia que tiene la actual resistencia antibiótica en nuestra población y el impacto del conocimiento del microbioma de las ciudades y sus superficies, así como de sus habitantes. “Actualmente existen grandes bases de datos de microbioma en el hemisferio norte, no así de nuestra radiografía latinoamericana. Siempre investigamos usando datos de afuera. Necesitamos generar datos chilenos para estudiar microbiomas de nuestras ciudades y personas”, precisó.

Ugalde se dedica a la vigilancia genómica en patógenos. No obstante, su formación de pregrado fue la biotecnología, contando además con un doctorado en biología marina. “Siempre me interesó la bioinformática como una herramienta para usar la computación en el análisis de datos biológicos. Actualmente, en mi equipo de trabajo construimos datos crudos para convertir en genoma de bacterias y comparar a mayor escala. Contamos con más de 3 mil genomas de distintos lugares, el reto está en disponibilizarlos de forma amigable”.

El especialista también profundizó sobre una investigación que realiza junto a su equipo, a través del** estudio de comunidades ambientales en espacios urbanos como el Metro de Santiago**. Según sus antecedentes, el transporte público representa un 2% del territorio pero es donde se realiza el 80% de las actividades humanas, convirtiéndose en un laboratorio natural y representativo de nuestro quehacer como población.

“En Chile, entre 2016 y 2025 tomamos muestras en el Metro. (…) En las superficies de este transporte encontramos todos los agentes patógenos propios de nuestra vida y si bien no nos enferman propiamente tal, sí hablan de nuestra conducta y hábitos”, comentó. Con este registro, Chile es parte de un estudio global de 60 ciudades, cuyo objetivo es describir la diversidad en biomas de ambientes urbanos y transformar esta información en una herramienta útil y pública, para comprender -entre otros aspectos- los cambios en la resistencia antibiótica.

Ugalde también afirmó que existe un margen para mejorar el procesamiento de datos y almacenamiento, así como para acelerar el análisis comparativo de genomas, facilitar la visualización para no expertos, y contribuir a la diseminación de data.

En ese sentido, identificó oportunidades de colaboración con Data Observatory, con el fin de mejorar la disponibilidad, manejo de información, visualización y almacenamiento de datos genómicos. Para una etapa posterior, apostó por la importancia de incorporar una capa de georreferenciación y visualización en un mapa interactivo, que considere variables de tiempo y espacio.